More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3184 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  93.81 
 
 		 485 aa  868    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 485 aa  941    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.72 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.89 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  49.89 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.28 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  46.35 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.33 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.33 
 
 		 515 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.67 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.47 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.26 
 
 		 505 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  48.36 
 
 		 472 aa  312  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 478 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.32 
 
 		 486 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.8 
 
 		 482 aa  280  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  40.57 
 
 		 488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.97 
 
 		 491 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  29.16 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.35 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.35 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.38 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 477 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 477 aa  183  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.38 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.78 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  37.35 
 
 		 437 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  29.37 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.12 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.03 
 
 		 480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.03 
 
 		 480 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 480 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 480 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.18 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27.56 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 471 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  34.38 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.6 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.68 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.28 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6290  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167913  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.07 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 		 554 aa  148  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2063  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569208  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.61 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.13 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 485 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 483 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0828  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.04 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  32.37 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>