More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0748 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  72.38 
 
 
496 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
493 aa  963    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
485 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.44 
 
 
487 aa  355  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.33 
 
 
486 aa  349  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  47.61 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.9 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  44.12 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
478 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
478 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  44.54 
 
 
485 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.29 
 
 
515 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
478 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  44.18 
 
 
486 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  44.97 
 
 
480 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  43.8 
 
 
475 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.64 
 
 
482 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.95 
 
 
503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
478 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.7 
 
 
486 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.74 
 
 
505 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
504 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.26 
 
 
468 aa  249  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.64 
 
 
491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  35.74 
 
 
488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 
478 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 
468 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.79 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.6 
 
 
484 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 
477 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  28.57 
 
 
480 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
481 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
480 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
477 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
480 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.36 
 
 
483 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  28.96 
 
 
480 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
480 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 
480 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
480 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
480 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.36 
 
 
480 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.36 
 
 
480 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
480 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 
437 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 
477 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
547 aa  156  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
478 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.04 
 
 
480 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.54 
 
 
485 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 
477 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  29.67 
 
 
478 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.54 
 
 
500 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  28.27 
 
 
503 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
477 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  41.31 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.69 
 
 
468 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  30.5 
 
 
493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.6 
 
 
517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.37 
 
 
477 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.39 
 
 
477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
477 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
477 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  26.77 
 
 
477 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  26.39 
 
 
477 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.39 
 
 
477 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.34 
 
 
477 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
477 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.29 
 
 
477 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
397 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
498 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
399 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.84 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
480 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.3 
 
 
490 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  33.22 
 
 
377 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
409 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
471 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
482 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
482 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 
482 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
482 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5401  transcriptional regulator  32.25 
 
 
470 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 
482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.87 
 
 
498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
477 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
482 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  27.24 
 
 
396 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  25.61 
 
 
482 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  31.07 
 
 
464 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
482 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3481  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.679234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4885  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>