More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2441 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 449 aa  900    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  44.73 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.16 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.22 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.79 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1835  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.422733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  43.12 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1901  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1854  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  43.06 
 
 		 485 aa  319  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.7 
 
 		 505 aa  318  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.85 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.22 
 
 		 486 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.42 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  45.6 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  41.19 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.96 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  40.05 
 
 		 480 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 504 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.41 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 482 aa  259  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  34.87 
 
 		 488 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.14 
 
 		 491 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  36.01 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 468 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.23 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 480 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.91 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.37 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.25 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.3 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.06 
 
 		 484 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.25 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 480 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 480 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  25.9 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.59 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.59 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  25.27 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 377 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.21 
 
 		 477 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.79 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.78 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.57 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  26.03 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 477 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.29 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  27.49 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 498 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 547 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>