More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3402 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3402  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 515 aa  988    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000368024  hitchhiker  0.000012724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3410  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 485 aa  358  9e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.723571  decreased coverage  0.0095682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3184  regulatory protein GntR, HTH  45.33 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.29 
 
 		 493 aa  346  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.92 
 
 		 487 aa  337  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.86 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0620  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2248  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.17 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5956  putative transcriptional regulator, GntR family  43.76 
 
 		 486 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.072408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2369  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.14 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0925  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2441  GntR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1043  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.46 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3373  GntR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3924  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.83 
 
 		 468 aa  297  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.94 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2700  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  43.04 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0691632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4275  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.310254  normal  0.794822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4144  putative transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.805557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3344  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.87 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4172  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  37.33 
 
 		 488 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03897  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2084  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.87186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.01 
 
 		 491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2586  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0905182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6330  putative transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00057428  hitchhiker  0.00168096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.29 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 473 aa  163  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.81 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.54 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.04 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 469 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  27.99 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.12 
 
 		 482 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.93 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 480 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.72 
 
 		 483 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.72 
 
 		 480 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 480 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.14 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 480 aa  143  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.11 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.14 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.35 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.79 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.73 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.53 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  29.58 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  25.67 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1217  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.41 
 
 		 466 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 482 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 478 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 478 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 476 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>