More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1447 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  100 
 
 
368 aa  758    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  45.92 
 
 
380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  44.02 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  42.66 
 
 
383 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  43.55 
 
 
379 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 
377 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  36.04 
 
 
409 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  31.91 
 
 
376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  32.16 
 
 
373 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  32 
 
 
369 aa  210  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  33.51 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  32.62 
 
 
374 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  31.37 
 
 
374 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
372 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  30.7 
 
 
372 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  33.61 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  28.76 
 
 
372 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  29.83 
 
 
356 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  28.35 
 
 
404 aa  173  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 
382 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.88 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  33.7 
 
 
362 aa  162  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  31.15 
 
 
362 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  31.5 
 
 
380 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  30.81 
 
 
386 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  32.08 
 
 
374 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  30.57 
 
 
377 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  28.85 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.37 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.66 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.66 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  24.32 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  25 
 
 
380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  25 
 
 
392 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  24.7 
 
 
392 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  25.15 
 
 
387 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  27.13 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.52 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  24.39 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  25.96 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  27.36 
 
 
397 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.07 
 
 
415 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  25.07 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  26.38 
 
 
387 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  26.44 
 
 
393 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  26.32 
 
 
391 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  27.19 
 
 
398 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  29.48 
 
 
402 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  27.41 
 
 
404 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  29.14 
 
 
392 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  27.58 
 
 
410 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  27.3 
 
 
396 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  29.22 
 
 
413 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  26.44 
 
 
404 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  26.35 
 
 
395 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  26.62 
 
 
388 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  27.71 
 
 
397 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  25.3 
 
 
387 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 
414 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  27.81 
 
 
400 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  23.81 
 
 
387 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 
385 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  26.99 
 
 
399 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  28.78 
 
 
400 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  27.59 
 
 
399 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  27.81 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  24.85 
 
 
375 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  27.87 
 
 
396 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  26.36 
 
 
400 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  25.45 
 
 
399 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  26.2 
 
 
388 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  26.21 
 
 
404 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 
381 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  23.96 
 
 
404 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  28.25 
 
 
367 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 
412 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  28.96 
 
 
386 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  28.43 
 
 
409 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 
411 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  26.42 
 
 
401 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  25.28 
 
 
390 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  24.93 
 
 
404 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  24.16 
 
 
398 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  25.08 
 
 
399 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  29.84 
 
 
401 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  28.24 
 
 
399 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  27.01 
 
 
384 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  22.65 
 
 
387 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  26.18 
 
 
393 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  25.25 
 
 
393 aa  100  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07291  aminotransferases class-I  24.92 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.122313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  25.37 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  24.77 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  27.09 
 
 
374 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  25.29 
 
 
390 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  26.83 
 
 
387 aa  99.4  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07271  aminotransferases class-I  24.59 
 
 
392 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.232753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  26.59 
 
 
405 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  26.74 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 
383 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>