More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0549 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  82.11 
 
 		 383 aa  637    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  100 
 
 		 380 aa  791    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  80.11 
 
 		 382 aa  627  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  37.84 
 
 		 379 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  34.54 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  36.77 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  30.14 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  30.59 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  30.79 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  31.28 
 
 		 374 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  30.29 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  29.66 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  28.49 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  29.12 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  27.68 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.13 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.34 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  27.47 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  28.2 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  25.75 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  25.99 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  26.68 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  29.55 
 
 		 360 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  25.65 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  27.22 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  26.35 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  27.46 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.05 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  25.6 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  27.12 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  25.93 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.3 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  26.92 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  23.98 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  25.14 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  25.62 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  26.05 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  26.55 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  26.84 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  25.45 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  30.37 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  26.25 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  24.85 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  25.79 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  25.75 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  26.65 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  25.29 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  24.1 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  25.35 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  25.83 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  25.64 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  25.78 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.96 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.39 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  25.53 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  25.17 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  24.34 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  26.95 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  25.86 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  25.86 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  25.15 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  25.91 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  23.91 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  26.59 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  25.84 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  25.58 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  27.53 
 
 		 427 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  29.1 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.02 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  23.91 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  23.31 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  25.91 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  27.5 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  23.94 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  24.41 
 
 		 393 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  23.96 
 
 		 402 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  27.33 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  27.91 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24.24 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  26.54 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  25.9 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  25 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  26.89 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  26.3 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  24.4 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  27.95 
 
 		 410 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  25.66 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  25.51 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  24.85 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  25.51 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  23.65 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  23.45 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  26.38 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>