More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4257 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  100 
 
 		 374 aa  765    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  69.46 
 
 		 374 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  69.38 
 
 		 374 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  42.7 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.79 
 
 		 377 aa  338  7e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  42.74 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  39.47 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  44.05 
 
 		 409 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  40.7 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  39.41 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  38.01 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  36.39 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  33.15 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  32.12 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  33.24 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  29.89 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  31.07 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  30.25 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  26.35 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  30.94 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  31.48 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.1 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  31.8 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  30.23 
 
 		 399 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  30.34 
 
 		 403 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  29.91 
 
 		 392 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  29.37 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  27.87 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.11 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  28.4 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  28.66 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  26.74 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  30.45 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  26.79 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  26.79 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  26.55 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  29.38 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  25.62 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  24.77 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  28.48 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  28.21 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  27.88 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  27.08 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  28.87 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  28.19 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  27.13 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  27.33 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.09 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  26.98 
 
 		 384 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  27.68 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  27.15 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  25.08 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  25.55 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  27.95 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  26.63 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  27.21 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  24.39 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  24.39 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  25.64 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  24.41 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  27.57 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  27.3 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.52 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  25.44 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.52 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  26.04 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  26.71 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  27.37 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  27.53 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  29.18 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  23.78 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  26.93 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  27.81 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  25.48 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  25.08 
 
 		 388 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  30.62 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  26.96 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  24.44 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  25.63 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  27.93 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  26.5 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  27.48 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  26.54 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  27.05 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  27.63 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>