More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01751 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  100 
 
 		 374 aa  758    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  33.24 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  32.25 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  33.55 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  32.62 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  31.65 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  30.48 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  32 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  30.77 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.96 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  35.22 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  32.08 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  35.16 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  30.85 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  29.53 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  30.3 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  33.03 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  26.64 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.75 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  40.76 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  30.07 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  31.39 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  29.83 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 401 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  26.53 
 
 		 404 aa  109  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  28.61 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  28.14 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  29.33 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.79 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  26.15 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  31.84 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  27.67 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  36.32 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  27.67 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2271  aminotransferase AlaT  27.41 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0597182  normal  0.143817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  34.6 
 
 		 406 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  25.71 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  25.71 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  34.31 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1160  aminotransferase  28.57 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  27.5 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  29.03 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  25.78 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  26.95 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  34.29 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  29.26 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  29.82 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  27.38 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  38.2 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  27.98 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  28.48 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  30.24 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  31.03 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  32.64 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  27.58 
 
 		 406 aa  99.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  28.01 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 		 402 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  28.85 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  28.21 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  26.92 
 
 		 414 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  34.13 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  29.2 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  31.3 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 		 411 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  33.5 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  33.5 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  26.71 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  29.06 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  31.4 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  26.62 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.65 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  28.52 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  29.06 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  29.41 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  26.17 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 		 409 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  28 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29.29 
 
 		 546 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  33.33 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>