More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01640 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  100 
 
 		 372 aa  764    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  79.3 
 
 		 372 aa  626  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  64.78 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  59.41 
 
 		 373 aa  479  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  50 
 
 		 376 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  49.73 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  38.01 
 
 		 374 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  37.1 
 
 		 374 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  36.12 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.29 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  33.84 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  30.95 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  28.76 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  28.13 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  28.7 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  28.49 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  29.39 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  27.51 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  26.27 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  27.04 
 
 		 362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  26.57 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  27.96 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  27.96 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  25.5 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  29.53 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  28.85 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  26.32 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  28.07 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  26.41 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  29.47 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  26.39 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  26.55 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  30.29 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  25.81 
 
 		 408 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  28.43 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  30.39 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  28.93 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  28.25 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  27.46 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  27.49 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  28.2 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  25.67 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  30.16 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  26.87 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  30.6 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  26.71 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  29.49 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  29.18 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  29.97 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.88 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  25.59 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  29.02 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  22.85 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  24.41 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  30.07 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.81 
 
 		 397 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  26.96 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  28.93 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  24.63 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  24.63 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  30.07 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  26.97 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  24.78 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  30.07 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  28.32 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  30.07 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  26.47 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  23.4 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  29.08 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  30.09 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  23.92 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  26.37 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.5 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  24.85 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  26.24 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  28.62 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  26.35 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  26.84 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  26.84 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  30.17 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  25.3 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  24.41 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  29.08 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  29.08 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  25.65 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  29.41 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.84 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  27.78 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  27.9 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>