More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1580 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 382 aa  769    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  32.14 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  31.09 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  31.95 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  31.01 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  32.93 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  29.27 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  33.15 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  34.57 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  29.31 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  29.09 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  28.35 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  27.87 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  28.03 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  34.31 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  27.81 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.09 
 
 		 377 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  27.87 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  26.97 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  30.7 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  26.93 
 
 		 362 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  27.56 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2619  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  28.8 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1119  aminotransferase class I and II  28.36 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  23.16 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  23.74 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  30.79 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  23.16 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  28.44 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  26.9 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.71 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  28.53 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  25.58 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  24.09 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  29.91 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.58 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  29.71 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  30.22 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  29.14 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  23.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  24.17 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  22.31 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  23.29 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  22.16 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  24.66 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  26.21 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  25.69 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  25 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  25.89 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  23.01 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  23.01 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  23.01 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  23.01 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  23.01 
 
 		 395 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.33 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  24.08 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  24.12 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  22.74 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2821  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  23.01 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.27 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  26.46 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  22.19 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  25.15 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  22.74 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  29.86 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  22.19 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  24.14 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  27.79 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  27.87 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  25.61 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  23.68 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  24.57 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  25.78 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  24.41 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  28.4 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  22.86 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  26.77 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  24.78 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  27.05 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  22.29 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  26.09 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  27.8 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  28.88 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  24.03 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  26.48 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  26.17 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  28.09 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>