More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2069 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
375 aa  734    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  66.76 
 
 
374 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  62.37 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  44.13 
 
 
387 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  39.85 
 
 
459 aa  256  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  43.33 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  42.2 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.04 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  43.52 
 
 
391 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  41.27 
 
 
387 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.6 
 
 
387 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  43.22 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  41.67 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 
382 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  42.97 
 
 
401 aa  242  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  41.22 
 
 
391 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  42.67 
 
 
387 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.58 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  42.78 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  42.78 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  41.58 
 
 
392 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  42.51 
 
 
409 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  42.22 
 
 
381 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  41.43 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  42.26 
 
 
402 aa  232  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  42.31 
 
 
397 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  40.21 
 
 
382 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.91 
 
 
402 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  40.51 
 
 
397 aa  229  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  42.89 
 
 
413 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  39.63 
 
 
382 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  38.79 
 
 
382 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  40.32 
 
 
391 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  41.71 
 
 
394 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.63 
 
 
413 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  41.38 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  40.85 
 
 
397 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  38.13 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  38.56 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  37.43 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  38.13 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  39.16 
 
 
382 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  39.3 
 
 
383 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  39.25 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  37.53 
 
 
384 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  38.61 
 
 
384 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  40.06 
 
 
395 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.21 
 
 
408 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  41.55 
 
 
383 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  40.75 
 
 
391 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.23 
 
 
387 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  41.18 
 
 
388 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  39.01 
 
 
389 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  37.2 
 
 
382 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  39.14 
 
 
384 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  40.16 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  37.97 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  36.27 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  37.4 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  36.91 
 
 
382 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  38.42 
 
 
382 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  38.36 
 
 
391 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  36.86 
 
 
421 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  38.92 
 
 
386 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  35.84 
 
 
385 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 
421 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 
395 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 
389 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10073  predicted protein  35.94 
 
 
431 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  39.95 
 
 
384 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  39.63 
 
 
384 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 
413 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  39.89 
 
 
384 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  39.89 
 
 
384 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  39.41 
 
 
394 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  40 
 
 
383 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  37.05 
 
 
390 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  35.9 
 
 
405 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  35.25 
 
 
391 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.34 
 
 
417 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  34.93 
 
 
389 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 
379 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  38.56 
 
 
384 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 
393 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  35.34 
 
 
390 aa  202  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  39.36 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  38.87 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  33.42 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  34.7 
 
 
460 aa  200  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  35.83 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
381 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  40.05 
 
 
409 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  35.49 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  39.41 
 
 
384 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  35.28 
 
 
394 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  36.53 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  36.53 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  36.53 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>