More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10073 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_10073  predicted protein  100 
 
 		 431 aa  892    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  42.47 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  33.41 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  36.05 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  35.25 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  36.51 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45065  predicted protein  32.63 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  35.51 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  33.95 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  37.21 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  33.41 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.48 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  30.47 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  35.19 
 
 		 413 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  35.03 
 
 		 389 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  35.42 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  36.24 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 382 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  34.94 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  34.57 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  34.56 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  35.94 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  33.72 
 
 		 394 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  33.72 
 
 		 369 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.26 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  32.41 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  32.56 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  33.02 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  33.95 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  33.87 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  34.65 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  32.79 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  33.72 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  32.79 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  33.18 
 
 		 384 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  32.87 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  34.72 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  34.88 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  31.86 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  33.87 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  31.41 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  33.49 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  33.49 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  33.72 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  33.72 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.03 
 
 		 413 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  31.64 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  30.39 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  31.38 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.87 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  31.38 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  31.72 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  30.95 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  33.02 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.72 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  31.41 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  33.03 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  33.72 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  32.1 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  33.26 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  31.32 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  32.71 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  31.32 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.85 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05616  kynurenine aminotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11190)  30.16 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  33.02 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  31.09 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.34 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  30.79 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  30.86 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  31.94 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 		 393 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  31.79 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  30.86 
 
 		 384 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  31.64 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  30.23 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  33.49 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  33.49 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  30.23 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  31.57 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  33.72 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  30.23 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  32.33 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  31.4 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  31.02 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  30.23 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  30.23 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  31.15 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  34.67 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  31.4 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  31.86 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  31.86 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>