More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1518 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 374 aa  754    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  76.42 
 
 		 374 aa  581  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  62.37 
 
 		 375 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  42.05 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  40.93 
 
 		 387 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  34.98 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  39.84 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.89 
 
 		 402 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  39.42 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.78 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  39.4 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  39.2 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  39.46 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  40.37 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  39.14 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  38.36 
 
 		 394 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  38.99 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  38.2 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  37.77 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  37.03 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  39.41 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  39.68 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  39.73 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  39.26 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  39.73 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.73 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.52 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  41.87 
 
 		 413 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  40.64 
 
 		 382 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  40.16 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  38.56 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  37.83 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.63 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  38.99 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  40.43 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  38.11 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  37.63 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.01 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  37.08 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  35.58 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  37.03 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  37.1 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  35.9 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  36.55 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  37.67 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  37.4 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  36.44 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  36.34 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  34.68 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  39.36 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  34.41 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  39.2 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  38.5 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  37.63 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  35.81 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  39.14 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  35.66 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  36.2 
 
 		 409 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  35.51 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  34.5 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  34.75 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  37.14 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  32.63 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  35.14 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  39.43 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  33.69 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  36.83 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  35.28 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  34.14 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  34.14 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  32.61 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  31.7 
 
 		 390 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  33.6 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  34.95 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  34.22 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  35.16 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  36.13 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  33.95 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.95 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  34.41 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  33.95 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  35.77 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  34.54 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  34.14 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  34.14 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  34.14 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  35.77 
 
 		 389 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  35.77 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  35.77 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  34.56 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  35.25 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  35.25 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  35.25 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>