More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0078 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  79.47 
 
 		 382 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0078  putative aminotransferase  100 
 
 		 384 aa  793    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000612  transcriptional regulator GntR family/aspartate aminotransferase  80.53 
 
 		 382 aa  641    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.379678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.07 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  35.46 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  35.62 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  33.67 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1713  aminotransferase, class I and II  35.73 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  34.97 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  34.72 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  34.72 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  35.62 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  35.62 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  35.62 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  35.62 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  34.55 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  35.62 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  35.62 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  34.56 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 395 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  34.46 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  32.63 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  33.16 
 
 		 406 aa  215  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  32.65 
 
 		 398 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  35.97 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  34.2 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  33.16 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3278  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 401 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3618  putative aminotransferase  35.11 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  34.88 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  34.54 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43130  putative aminotransferase  34.86 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000231871  normal  0.186094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2671  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  35.6 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 398 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  33.08 
 
 		 402 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  31.85 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  33.92 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0992  putative transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.26 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  30.65 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.72 
 
 		 517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  30.49 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 436 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  30.25 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>