More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0992 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0992  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 388 aa  761    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.97 
 
 		 416 aa  270  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  39.59 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  43.47 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.58 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  36.58 
 
 		 432 aa  256  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  39.79 
 
 		 393 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.23 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.79 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.79 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 396 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.15 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  37.78 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.48 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  39.21 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.48 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.62 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.67 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.43 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  43.42 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 438 aa  239  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  39.29 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  38.97 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.26 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.99 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 437 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.48 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.48 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.48 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.48 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.48 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.48 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.13 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  43.19 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  37.15 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.12 
 
 		 446 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 403 aa  229  8e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 440 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.42 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  38.87 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 400 aa  225  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 403 aa  225  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 		 406 aa  225  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  37.28 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.12 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  36.03 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 441 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  44.06 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.45 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  34.63 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  38.18 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>