More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5125 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  88.41 
 
 
233 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  73.48 
 
 
248 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  73.48 
 
 
248 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  73.48 
 
 
232 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
231 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
237 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  45.81 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
229 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
229 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.67 
 
 
229 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
229 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.64 
 
 
218 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
252 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
230 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.21 
 
 
238 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 
229 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
231 aa  128  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.66 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.13 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.37 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  31.92 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.45 
 
 
298 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
253 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.26 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2864  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
708 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  27.19 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.27 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
288 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4582  multifunctional 3-hydroxybutyryl-CoA epimerase/delta(3)-cis-delta(2)-trans-enoyl-CoA isomerase/enoyl-CoA hydratase /3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.8 
 
 
696 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615246  decreased coverage  0.00280098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0915  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
686 aa  58.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630385  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3363  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  25.96 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.29 
 
 
692 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  25.19 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2142  fatty oxidation complex, alpha subunit, putative  34.33 
 
 
694 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  26.32 
 
 
270 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30150  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
734 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.494591  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  33.33 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2934  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  27.84 
 
 
711 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1028  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.84 
 
 
694 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.272487  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1929  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.84 
 
 
694 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.534634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2573  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
699 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187929  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1926  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.58 
 
 
694 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.856984  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  27.16 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.69 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  27.65 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.79 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2703  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
268 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41088  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2796  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.84 
 
 
711 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732843  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1855  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
693 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202152  normal  0.373323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6173  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.84 
 
 
694 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1906  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.84 
 
 
694 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2925  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.35 
 
 
701 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  29.03 
 
 
296 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1824  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.84 
 
 
694 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
257 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
266 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5207  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
694 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
262 aa  52  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1516  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding protein  34.68 
 
 
716 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0636546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1894  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.84 
 
 
694 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1539  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.68 
 
 
716 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6221  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  27.98 
 
 
710 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368406  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2226  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.48 
 
 
697 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0438642  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.1 
 
 
261 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7065  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.68 
 
 
253 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.86 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.55 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  28.89 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>