More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0650 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  100 
 
 
252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
257 aa  208  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.86 
 
 
260 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.46 
 
 
260 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
257 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
253 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
257 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
262 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
256 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
261 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.42 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
260 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
258 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
259 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.26 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.81 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
258 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.5 
 
 
260 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
259 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
258 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
257 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
258 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
258 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
259 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
257 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
262 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
258 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.28 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.35 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
257 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.81 
 
 
248 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
258 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
257 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
257 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.98 
 
 
257 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  33.73 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
258 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
259 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
257 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
259 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
258 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
262 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
264 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
258 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>