More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1548 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.33 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.85 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  38.99 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.8 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.8 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.77 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.58 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2728  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.74 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0237871  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  32.89 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.25 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  38.5 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  37.37 
 
 		 273 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.89 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2944  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  32.93 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.06 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3358  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  32.33 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2400  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  32.33 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  33.81 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2047  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.04 
 
 		 276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  34.06 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  37.19 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  36.17 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.61 
 
 		 651 aa  125  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.46 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.32 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.32 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.05 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5908  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.35 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.74 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.77 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>