More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2001 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.4 
 
 
252 aa  308  5e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  54.23 
 
 
662 aa  285  4e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  53.28 
 
 
661 aa  280  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  51.54 
 
 
662 aa  275  5e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  51.35 
 
 
659 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  52.31 
 
 
662 aa  272  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  52.71 
 
 
663 aa  267  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.42 
 
 
265 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.34 
 
 
261 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 
262 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.11 
 
 
261 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.69 
 
 
260 aa  246  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.92 
 
 
260 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
260 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.54 
 
 
260 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  46.51 
 
 
651 aa  240  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.31 
 
 
260 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  47.71 
 
 
258 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 
267 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.15 
 
 
260 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  48.24 
 
 
261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
269 aa  234  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  51.24 
 
 
260 aa  232  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
258 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
259 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.42 
 
 
266 aa  232  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
259 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
258 aa  231  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  47.15 
 
 
257 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.06 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 
257 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 
257 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 
257 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  43.31 
 
 
258 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
261 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  43.31 
 
 
258 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
257 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 
258 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
258 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
260 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 
257 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
259 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
260 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
257 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
267 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.9 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  47.04 
 
 
260 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.77 
 
 
260 aa  224  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
260 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
257 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
260 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
260 aa  221  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.85 
 
 
260 aa  221  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
257 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
257 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
257 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
253 aa  219  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
258 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
268 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 
260 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
258 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
260 aa  218  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.86 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.21 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
257 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.62 
 
 
260 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
262 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  48.77 
 
 
257 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
259 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
262 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
259 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
257 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  45.59 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
260 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
264 aa  215  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
257 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 
257 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
262 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
258 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.59 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>