More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4239 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  523  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.69 
 
 
260 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.2 
 
 
258 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  56.15 
 
 
260 aa  275  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  49.24 
 
 
261 aa  255  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
260 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
260 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.82 
 
 
265 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  46.33 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  46.74 
 
 
259 aa  232  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.15 
 
 
260 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.39 
 
 
260 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.45 
 
 
260 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.98 
 
 
260 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 
260 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
260 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.78 
 
 
265 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.16 
 
 
258 aa  222  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.74 
 
 
260 aa  221  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
260 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.67 
 
 
258 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 
260 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
261 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.83 
 
 
260 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
267 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.43 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.06 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
268 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
258 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 
260 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
261 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.93 
 
 
260 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
260 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 
257 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.51 
 
 
260 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
261 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
260 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  48.28 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.33 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  44.72 
 
 
663 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.35 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
260 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
259 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  46.83 
 
 
257 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  41.54 
 
 
663 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.1 
 
 
252 aa  196  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.29 
 
 
256 aa  196  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  45.38 
 
 
661 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  42.53 
 
 
659 aa  196  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  42.53 
 
 
654 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
260 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.89 
 
 
259 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 
262 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
263 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
263 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  44.18 
 
 
258 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
261 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.56 
 
 
253 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  44.18 
 
 
258 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
251 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
266 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42 
 
 
662 aa  190  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.6 
 
 
662 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.89 
 
 
258 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
258 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
254 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
259 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
262 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
256 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
258 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
257 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  41.83 
 
 
657 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
258 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
263 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
258 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
260 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
260 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
261 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42 
 
 
662 aa  185  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
260 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>