More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1462 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  93.44 
 
 
259 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 
260 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  57.98 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.91 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.73 
 
 
260 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.95 
 
 
260 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.53 
 
 
260 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
260 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.7 
 
 
260 aa  251  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  49.03 
 
 
260 aa  245  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.25 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.03 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.04 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.04 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  46.48 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 
257 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.44 
 
 
260 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.08 
 
 
260 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
257 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 
257 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.6 
 
 
260 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.24 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
257 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
253 aa  224  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
260 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.61 
 
 
256 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
260 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.69 
 
 
260 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
260 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
258 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
258 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
258 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 
258 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 
258 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
259 aa  216  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  47.45 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
260 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  45.24 
 
 
260 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
258 aa  215  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
260 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
260 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  45.1 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  47.27 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 
258 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  46.37 
 
 
269 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
257 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
265 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.01 
 
 
265 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
260 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
261 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
258 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
261 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.88 
 
 
257 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
258 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
258 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  45.27 
 
 
262 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.57 
 
 
260 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.28 
 
 
262 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
260 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
257 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.8 
 
 
257 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.34 
 
 
258 aa  206  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
258 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
257 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
260 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
257 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
256 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
258 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
259 aa  204  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
258 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
259 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
258 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
258 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
259 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.74 
 
 
662 aa  203  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
258 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
267 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.28 
 
 
260 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.62 
 
 
260 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
268 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
259 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
264 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
257 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
259 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
258 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  44.02 
 
 
662 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
260 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
259 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
257 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>