More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1492 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.49 
 
 
260 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 
260 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.35 
 
 
260 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.61 
 
 
260 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.97 
 
 
260 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 
260 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  49.81 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
260 aa  251  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
260 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.03 
 
 
260 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  49.23 
 
 
260 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.02 
 
 
258 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
257 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.88 
 
 
260 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
258 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
267 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
262 aa  240  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 
260 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.42 
 
 
259 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 
259 aa  240  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.42 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  47.29 
 
 
662 aa  239  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.59 
 
 
257 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  46.51 
 
 
662 aa  237  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  46.12 
 
 
662 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.39 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  48.03 
 
 
663 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  47.81 
 
 
661 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
257 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
259 aa  231  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 
257 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
260 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
258 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.79 
 
 
264 aa  228  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  47.47 
 
 
257 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.06 
 
 
257 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 
258 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
258 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
257 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
257 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
257 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.1 
 
 
260 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 
257 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
257 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
258 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
257 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 
258 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
257 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
257 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 
257 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 
258 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
257 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  47.98 
 
 
257 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.61 
 
 
256 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 
257 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
258 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
257 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
258 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
265 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 
266 aa  223  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 
260 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.71 
 
 
260 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  46.51 
 
 
257 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
256 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
262 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  47.88 
 
 
260 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
268 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
258 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
257 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
258 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.37 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  44.98 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.94 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
262 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
259 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  48.4 
 
 
259 aa  221  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
259 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.31 
 
 
651 aa  221  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
258 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.56 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
259 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
260 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>