More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6304 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 
258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 
258 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 
258 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  62.04 
 
 
258 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 
258 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  62.04 
 
 
258 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 
258 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 
258 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  56.56 
 
 
257 aa  291  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.96 
 
 
262 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  58.51 
 
 
257 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  56.15 
 
 
257 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
260 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
258 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  59.18 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
257 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  57.5 
 
 
262 aa  284  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.05 
 
 
259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  55.97 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.91 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  59.59 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  56.05 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  53.12 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  59.18 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.69 
 
 
258 aa  281  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  55.95 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
257 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
257 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
257 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 
258 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  54.92 
 
 
257 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  55.74 
 
 
255 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  55.37 
 
 
259 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  54.29 
 
 
258 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 
258 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.22 
 
 
259 aa  278  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.64 
 
 
258 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.85 
 
 
257 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.79 
 
 
258 aa  278  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  55.12 
 
 
257 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.66 
 
 
259 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.96 
 
 
257 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.51 
 
 
258 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
257 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  54.22 
 
 
258 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  53.69 
 
 
257 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.15 
 
 
259 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.4 
 
 
258 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  52.4 
 
 
258 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.6 
 
 
258 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.25 
 
 
259 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  58.44 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.69 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.61 
 
 
258 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  55.33 
 
 
257 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.51 
 
 
257 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  55.74 
 
 
257 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.1 
 
 
257 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.36 
 
 
255 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  56.13 
 
 
257 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.4 
 
 
258 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  55.97 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.15 
 
 
266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.8 
 
 
258 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  53.17 
 
 
265 aa  269  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 
258 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
258 aa  268  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.75 
 
 
257 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.51 
 
 
257 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.1 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.1 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.36 
 
 
258 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 
257 aa  265  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.23 
 
 
254 aa  264  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  55.87 
 
 
261 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.23 
 
 
265 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.31 
 
 
256 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 
266 aa  262  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
258 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  52.07 
 
 
251 aa  260  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.59 
 
 
262 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.36 
 
 
259 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4646  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.83 
 
 
259 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.59 
 
 
259 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.01 
 
 
259 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  51.22 
 
 
258 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.59 
 
 
259 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 
259 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  50 
 
 
275 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>