More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1936 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  68.08 
 
 
260 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  65 
 
 
260 aa  344  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  63.46 
 
 
260 aa  334  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.15 
 
 
260 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.38 
 
 
260 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  60 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  59.62 
 
 
260 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.14 
 
 
260 aa  314  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  55.64 
 
 
258 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  58.91 
 
 
256 aa  288  6e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.54 
 
 
259 aa  279  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 
260 aa  265  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.81 
 
 
258 aa  265  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  49.24 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
260 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  52.57 
 
 
260 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
267 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.04 
 
 
260 aa  242  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.41 
 
 
258 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 
260 aa  240  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
261 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
265 aa  238  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 
259 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.89 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
259 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 
257 aa  234  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.84 
 
 
269 aa  234  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 
260 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
260 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  47.71 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  47.31 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.45 
 
 
267 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 
259 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
259 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 
259 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
260 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.72 
 
 
253 aa  228  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
260 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
260 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  47.47 
 
 
260 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
261 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 
265 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  48.46 
 
 
260 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.91 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
259 aa  221  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  46.95 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.21 
 
 
257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 
257 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
258 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  45.8 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
258 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
261 aa  214  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
257 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  47.52 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  47.52 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.85 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  43.89 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
258 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
259 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
257 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
258 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.19 
 
 
662 aa  208  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
258 aa  208  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
262 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 
260 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
258 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
262 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
260 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  42.29 
 
 
663 aa  206  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
258 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
259 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 
256 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
262 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
257 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
258 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
258 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
257 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 
258 aa  204  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 
260 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  44.62 
 
 
651 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
261 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
258 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>