More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3584 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.12 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.82 
 
 
265 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.96 
 
 
260 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.57 
 
 
260 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 
262 aa  214  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.38 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.84 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  48.08 
 
 
661 aa  210  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
268 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
260 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 
263 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.38 
 
 
662 aa  209  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  44.83 
 
 
662 aa  209  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  48.58 
 
 
663 aa  209  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
258 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
260 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  43.85 
 
 
659 aa  206  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
260 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45 
 
 
662 aa  204  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
260 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.41 
 
 
260 aa  204  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
261 aa  204  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 
261 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
261 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.02 
 
 
256 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
259 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
256 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
258 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.1 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.02 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.02 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
263 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.97 
 
 
268 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 
260 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
258 aa  198  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.22 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
267 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
270 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 
259 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.41 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
258 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 
258 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
260 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.95 
 
 
260 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.96 
 
 
271 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
260 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
257 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
259 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
261 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
257 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  43.2 
 
 
275 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
257 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
257 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
258 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
260 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
257 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
263 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
259 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
256 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 
254 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 
258 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
261 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  44 
 
 
262 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
257 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
255 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.1 
 
 
260 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.19 
 
 
651 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  42.46 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  42.46 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
257 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
257 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 
259 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
257 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
258 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 
259 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
262 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
251 aa  187  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  42.51 
 
 
255 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  42.51 
 
 
255 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 
258 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.95 
 
 
259 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>