More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2792 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  93.44 
 
 
259 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  64.2 
 
 
260 aa  348  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  58.75 
 
 
260 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.3 
 
 
260 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.73 
 
 
260 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.95 
 
 
260 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.53 
 
 
260 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.36 
 
 
260 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.7 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  48.25 
 
 
260 aa  241  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.82 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.25 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
257 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 
262 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
257 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.05 
 
 
260 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.25 
 
 
260 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.08 
 
 
260 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.85 
 
 
260 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  50 
 
 
256 aa  227  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.84 
 
 
260 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
260 aa  225  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 
257 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
257 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.81 
 
 
260 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.47 
 
 
260 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
260 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  46.03 
 
 
260 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
260 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
267 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  46.06 
 
 
258 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  47.45 
 
 
257 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
260 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
260 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 
260 aa  215  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.3 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
260 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
261 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
260 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  44.71 
 
 
258 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
265 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
261 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  44.86 
 
 
262 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  47.27 
 
 
257 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.12 
 
 
262 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
258 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
257 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.34 
 
 
258 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
258 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  44.76 
 
 
269 aa  206  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
267 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.19 
 
 
260 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.7 
 
 
258 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
258 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 
258 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
259 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
258 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  43.92 
 
 
258 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
258 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
260 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
264 aa  204  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
258 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
256 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 
269 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
260 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
257 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
258 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
258 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
256 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
266 aa  202  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
261 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
258 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
258 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
257 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
257 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
257 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
265 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
257 aa  201  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
258 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
257 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
257 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
258 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
268 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>