More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2833 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  97.31 
 
 		 260 aa  510  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.38 
 
 		 260 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  69.62 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.73 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.73 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  50.38 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.31 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.85 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.74 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  51.36 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.54 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.54 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.78 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.6 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 		 257 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.77 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.38 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 		 267 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.62 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  44.87 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  48.25 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.21 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.98 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  44.57 
 
 		 275 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.98 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  40.31 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.92 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.53 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.56 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  45.1 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  45.42 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.53 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>