More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1843 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.61 
 
 
257 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.61 
 
 
257 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  97.27 
 
 
257 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  80.93 
 
 
257 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.95 
 
 
257 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  75.78 
 
 
257 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.37 
 
 
256 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.93 
 
 
259 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.98 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.73 
 
 
258 aa  355  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  64.2 
 
 
257 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  65.76 
 
 
257 aa  351  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.15 
 
 
257 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  64.73 
 
 
258 aa  349  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  348  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.76 
 
 
257 aa  344  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 
257 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.18 
 
 
258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  63.81 
 
 
257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.57 
 
 
258 aa  342  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  66.02 
 
 
258 aa  340  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  63.04 
 
 
257 aa  340  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  64.71 
 
 
259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  63.81 
 
 
257 aa  337  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  64.73 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.63 
 
 
258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  63.53 
 
 
257 aa  334  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  64.98 
 
 
257 aa  334  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  63.53 
 
 
257 aa  334  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.02 
 
 
258 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 
258 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  61.24 
 
 
258 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  62.79 
 
 
258 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.53 
 
 
258 aa  332  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 
258 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.18 
 
 
258 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 
257 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  62.35 
 
 
260 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 
258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.04 
 
 
258 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 
258 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  62.7 
 
 
265 aa  327  9e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  64.34 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
258 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  65.12 
 
 
264 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.63 
 
 
258 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 
258 aa  321  8e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  61.24 
 
 
258 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  62.4 
 
 
258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  62.4 
 
 
258 aa  318  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  62.79 
 
 
258 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  62.79 
 
 
258 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 
262 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  63.95 
 
 
258 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  62.79 
 
 
258 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.3 
 
 
259 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  60.46 
 
 
262 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  63.18 
 
 
258 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  63.18 
 
 
258 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.62 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  61.15 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  64.34 
 
 
258 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  61.39 
 
 
259 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.11 
 
 
259 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.55 
 
 
259 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  61.72 
 
 
277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.48 
 
 
259 aa  308  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  59.45 
 
 
255 aa  308  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.04 
 
 
258 aa  308  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.16 
 
 
259 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.62 
 
 
259 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.98 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 
257 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.03 
 
 
262 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 
261 aa  299  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.98 
 
 
249 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.77 
 
 
259 aa  298  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.27 
 
 
236 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
257 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.2 
 
 
259 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  60.25 
 
 
269 aa  295  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.62 
 
 
260 aa  293  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  56.87 
 
 
262 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.14 
 
 
265 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5078  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.02 
 
 
262 aa  291  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4646  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.63 
 
 
259 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.42 
 
 
256 aa  289  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.64 
 
 
256 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.71 
 
 
258 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.94 
 
 
258 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>