More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3623 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.61 
 
 
259 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  90.7 
 
 
259 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  89.19 
 
 
259 aa  477  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.87 
 
 
259 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.94 
 
 
259 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.3 
 
 
262 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  79.01 
 
 
262 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4646  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.88 
 
 
259 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  73.36 
 
 
258 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  72.2 
 
 
258 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  72.59 
 
 
258 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  71.81 
 
 
258 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  72.97 
 
 
258 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  72.59 
 
 
258 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  72.05 
 
 
262 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  73.75 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  73.36 
 
 
258 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  73 
 
 
264 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  72.59 
 
 
258 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  73.36 
 
 
258 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  72.2 
 
 
258 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  74.13 
 
 
258 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  70.66 
 
 
258 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  70.27 
 
 
258 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  70.66 
 
 
258 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  69.39 
 
 
258 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  71.43 
 
 
258 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.67 
 
 
265 aa  358  8e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.29 
 
 
249 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  64.23 
 
 
257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  63.82 
 
 
257 aa  341  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  64.86 
 
 
257 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  66.02 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  65.64 
 
 
257 aa  338  7e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.86 
 
 
258 aa  334  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
258 aa  331  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.84 
 
 
258 aa  331  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  64.86 
 
 
257 aa  331  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.34 
 
 
256 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  64.48 
 
 
257 aa  329  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 
257 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  66.02 
 
 
258 aa  329  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.5 
 
 
258 aa  328  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  62.93 
 
 
257 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 
257 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.02 
 
 
258 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  63.32 
 
 
258 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  62.93 
 
 
257 aa  322  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.67 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.11 
 
 
258 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.45 
 
 
258 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  62.65 
 
 
260 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.98 
 
 
258 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  61.39 
 
 
257 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.28 
 
 
257 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.98 
 
 
258 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  61.72 
 
 
257 aa  315  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 
258 aa  314  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.98 
 
 
258 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.16 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.62 
 
 
257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1190  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.41 
 
 
258 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.42 
 
 
257 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  63.41 
 
 
259 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.33 
 
 
259 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.72 
 
 
257 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.72 
 
 
257 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2128  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.41 
 
 
259 aa  308  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00663938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.72 
 
 
257 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.2 
 
 
258 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.75 
 
 
259 aa  305  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.24 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  63.49 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.78 
 
 
257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.14 
 
 
256 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  60.32 
 
 
255 aa  300  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  62.4 
 
 
257 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.85 
 
 
257 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  61.39 
 
 
258 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.31 
 
 
258 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.67 
 
 
259 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.67 
 
 
259 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.18 
 
 
254 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 
259 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.25 
 
 
259 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  58.75 
 
 
257 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  58.59 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  56.81 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.65 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.05 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  59.35 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>