More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0566 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  58.53 
 
 
258 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  45.39 
 
 
277 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.26 
 
 
253 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2320  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0702253  normal  0.0764248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
237 aa  185  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4034  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
270 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12846  enoyl-CoA hydratase  41.89 
 
 
249 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000117946  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2071  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
255 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0296797  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2088  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
255 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.109638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2134  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
255 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0100936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1871  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4495  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
258 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4139  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
257 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
245 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143774  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
250 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
268 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
262 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
260 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.65 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 
259 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
256 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.09 
 
 
262 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.95 
 
 
257 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
257 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
261 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
260 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
257 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
258 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
261 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
257 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
257 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
257 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
257 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
258 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
257 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  35.78 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35.78 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.42 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.75 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.56 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.19 
 
 
255 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.5 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
256 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  42.55 
 
 
260 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
266 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.67 
 
 
260 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
257 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
269 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
262 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
257 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
266 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
257 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.95 
 
 
259 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
260 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.25 
 
 
260 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
259 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
258 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
259 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  35.17 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.11 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  35.17 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 
260 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
258 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  34.59 
 
 
261 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>