More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2453 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.95 
 
 		 266 aa  298  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.82 
 
 		 266 aa  297  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  58.08 
 
 		 266 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  56.82 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.25 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  54.92 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.94 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.78 
 
 		 272 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  52.04 
 
 		 269 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 		 262 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  52.71 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  53.33 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  53.33 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.37 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.03 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  53.33 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  52.16 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.64 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 278 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.33 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  44.15 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.97 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.69 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.69 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.83 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  38.01 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.69 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.94 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  40.29 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  40.29 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.52 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  39.7 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>