More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4560 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 256 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.05 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  40.41 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  35.04 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.63 
 
 		 663 aa  156  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.82 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.82 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.55 
 
 		 659 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  37.4 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.07 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  37.4 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  37.86 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  39.53 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.71 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  41.34 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>