More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6299 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.81 
 
 
256 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  47.95 
 
 
256 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
259 aa  199  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  44.76 
 
 
662 aa  190  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.02 
 
 
662 aa  182  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.69 
 
 
662 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  41.15 
 
 
663 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  43.95 
 
 
661 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
264 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
268 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 
260 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
268 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 
263 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
258 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
260 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 
262 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
262 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
262 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
262 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
262 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
262 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 
262 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
256 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
261 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
262 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
260 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
259 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
266 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 
273 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.42 
 
 
267 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
259 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
259 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
264 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.39 
 
 
255 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
264 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.94 
 
 
260 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
260 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
260 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
258 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 
263 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
257 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
261 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.29 
 
 
260 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
265 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
263 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
258 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
263 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
260 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 
251 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 
258 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
257 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
262 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
258 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 
258 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.36 
 
 
260 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
259 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.88 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
259 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.27 
 
 
260 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
258 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
262 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
264 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.83 
 
 
263 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.27 
 
 
659 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
253 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 
259 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
261 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
260 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
263 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
259 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 
260 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
264 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
255 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.37 
 
 
255 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.37 
 
 
255 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
258 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>