More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2180 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.45 
 
 		 264 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  95.45 
 
 		 264 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  72.9 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.28 
 
 		 263 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.19 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.15 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.65 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  41.35 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.79 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.59 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.08 
 
 		 662 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.13 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.63 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>