More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.73 
 
 
260 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
261 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 
264 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.79 
 
 
273 aa  232  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.14 
 
 
274 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.28 
 
 
263 aa  228  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48 
 
 
257 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  51.28 
 
 
271 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  43.77 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  42.53 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
261 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 
260 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  48.74 
 
 
270 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
259 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0707  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 
263 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.266655  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.49 
 
 
263 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2482  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  45.24 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  45.24 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.79 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
256 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
262 aa  195  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.21 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
263 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
259 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.48 
 
 
277 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
263 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
270 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
262 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
265 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
262 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 
263 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
262 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
261 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
263 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
263 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  43.89 
 
 
263 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
266 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  45.29 
 
 
276 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  45.85 
 
 
262 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
262 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.91 
 
 
267 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
260 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
261 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.24 
 
 
260 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
265 aa  178  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
263 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
264 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7944  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.35 
 
 
261 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
263 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  47.62 
 
 
263 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 
259 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  41.89 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  48.03 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
265 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
260 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
270 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
261 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
256 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
265 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
264 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.67 
 
 
257 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
263 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
263 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 
278 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 
263 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 
263 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
258 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
262 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
264 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
266 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.69 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 
271 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
259 aa  165  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>