More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2341 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
266 aa  521  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.31 
 
 
257 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  48.4 
 
 
263 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
263 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
263 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
263 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 
263 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
263 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.38 
 
 
262 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
263 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
261 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.08 
 
 
263 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
262 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  54.2 
 
 
263 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
264 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
264 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 
262 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 
260 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 
261 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 
262 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
260 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
257 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.43 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
263 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
263 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
263 aa  194  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 
261 aa  194  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
262 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 
263 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
264 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  43.61 
 
 
263 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
255 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 
263 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
265 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.33 
 
 
267 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 
256 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
276 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
263 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
263 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
265 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 
265 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 
263 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
270 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
263 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
274 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
267 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 
267 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  38.19 
 
 
261 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
266 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
259 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 
260 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
260 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
262 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 
273 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
260 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
273 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
260 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
262 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
263 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
270 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
265 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
266 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
283 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 
270 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
258 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
259 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
270 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
264 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
274 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
272 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
265 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
266 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 
275 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>