More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2150 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
274 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.91 
 
 
260 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  57.62 
 
 
283 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  52.47 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  52.31 
 
 
261 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.99 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
270 aa  211  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
257 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  48.53 
 
 
271 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
261 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
260 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
263 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
262 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  46.51 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  39.46 
 
 
261 aa  195  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
259 aa  194  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
263 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 
266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.95 
 
 
262 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
263 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  41.88 
 
 
280 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
262 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
264 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  51.59 
 
 
263 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
263 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  47.83 
 
 
263 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  44.15 
 
 
261 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
262 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.08 
 
 
263 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
262 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  45.45 
 
 
262 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
262 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
260 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
261 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0707  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
263 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.266655  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  43.96 
 
 
276 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7944  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
261 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 
263 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.04 
 
 
267 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 
261 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
262 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 
255 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
263 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
264 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
264 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 
267 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
264 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
260 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.29 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
259 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
264 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
264 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  47.2 
 
 
263 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.95 
 
 
260 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  46.67 
 
 
263 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
264 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
258 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
277 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 
260 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 
263 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 
263 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
266 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
262 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.33 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
251 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 
268 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
266 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.64 
 
 
276 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
262 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
263 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  44 
 
 
263 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 
263 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
273 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
264 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
259 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>