More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19430 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
271 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
264 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.33 
 
 
260 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  47.25 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 
261 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  50.73 
 
 
283 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
261 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
273 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
260 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0707  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.71 
 
 
263 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.266655  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
259 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7944  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
261 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
263 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
257 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 
264 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2482  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.24 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.55 
 
 
262 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
262 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
255 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
263 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.84 
 
 
261 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.18 
 
 
260 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.38 
 
 
263 aa  175  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
264 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
264 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
267 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
256 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
260 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 
258 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
265 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
261 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
261 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
264 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  46.36 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.33 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
262 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
263 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
266 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
280 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
262 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
263 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
262 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
263 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
263 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
261 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
263 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
263 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
273 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
262 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41 
 
 
262 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
264 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
262 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
263 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
270 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
276 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
269 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
262 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
267 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
267 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
266 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
257 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
270 aa  151  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
262 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
264 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
268 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 
263 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
262 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
262 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
262 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
276 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
263 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
260 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>