More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1238 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  70.41 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  58.49 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.92 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 264 aa  291  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  60.39 
 
 		 264 aa  288  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.44 
 
 		 272 aa  288  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 		 280 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  55.64 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.98 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  56.87 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  56.49 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 		 263 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  54.41 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 		 276 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.94 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  55.98 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.64 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  53.64 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  57.79 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  52.43 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  53.79 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.79 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  51.7 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  42.7 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  52.45 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  51.7 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  48.31 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.3 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  56.03 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  51.69 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  43.92 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  46.44 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  45.59 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.7 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  45.35 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.41 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.71 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.29 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.21 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.46 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.17 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.07 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.39 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.26 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.01 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>