More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1715 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
264 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  60.15 
 
 
263 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  54.47 
 
 
280 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  55.82 
 
 
262 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 
263 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
263 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  53.05 
 
 
263 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  55.02 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  52.29 
 
 
263 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  52.67 
 
 
263 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
263 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
263 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  51.16 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.85 
 
 
262 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  52.67 
 
 
263 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
262 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
262 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  51.01 
 
 
264 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  60.62 
 
 
261 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 
262 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
264 aa  234  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.06 
 
 
262 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
263 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 
263 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
262 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 
263 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.16 
 
 
257 aa  229  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  55.89 
 
 
263 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 
263 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 
263 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 
263 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  56.63 
 
 
262 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  56.22 
 
 
262 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 
261 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 
262 aa  224  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 
263 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
274 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 
263 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  42.97 
 
 
261 aa  218  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  47.62 
 
 
263 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 
272 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
270 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  46.47 
 
 
267 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 
284 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 
263 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
266 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
266 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
266 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.31 
 
 
260 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 
258 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
266 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  49.18 
 
 
258 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.62 
 
 
256 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.16 
 
 
259 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
264 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
260 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
267 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.99 
 
 
258 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
258 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.7 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
265 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.21 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.65 
 
 
266 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 
268 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
260 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 
251 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
265 aa  163  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
266 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
278 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
256 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.62 
 
 
255 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
261 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
261 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
255 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.23 
 
 
255 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.23 
 
 
255 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
261 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
256 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>