More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3255 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  47.37 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  48.62 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  47.37 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  48.28 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  46.21 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  45.8 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  46.42 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  47.89 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.89 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  45.38 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.85 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  49.04 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  49.04 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  48.03 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  49.04 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  48.66 
 
 		 262 aa  215  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.81 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  48.22 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  46.36 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 263 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  46.95 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.7 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  46.95 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  38.76 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4822  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  43.45 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 		 274 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.68 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.69 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0433  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>