More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  98.48 
 
 
263 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.66 
 
 
264 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.66 
 
 
264 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.28 
 
 
264 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 
266 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
260 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.53 
 
 
263 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.84 
 
 
261 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
262 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
263 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
261 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.61 
 
 
662 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.05 
 
 
262 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
257 aa  158  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
261 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
256 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
262 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
265 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
271 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
274 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
264 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
266 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
263 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.74 
 
 
662 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
261 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
261 aa  155  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
270 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
264 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
259 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
260 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
255 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
256 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
264 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
262 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
268 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.64 
 
 
661 aa  149  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
267 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.47 
 
 
662 aa  149  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
264 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
262 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
263 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
263 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
263 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 
267 aa  148  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.72 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
268 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.23 
 
 
271 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
264 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.98 
 
 
273 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  42.57 
 
 
261 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
266 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 
263 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
273 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
264 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
266 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
261 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
263 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.27 
 
 
259 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
263 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
261 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
262 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
263 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
265 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  44.32 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
262 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  40.75 
 
 
264 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>