More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3283 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 263 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  97.72 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  93.92 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  85.5 
 
 		 263 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  73.66 
 
 		 263 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  62.07 
 
 		 262 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  63.12 
 
 		 263 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 		 262 aa  311  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  61.69 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  61.69 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 280 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 		 262 aa  305  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  57.03 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  61.24 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 260 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 		 261 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 		 276 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  56.15 
 
 		 262 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.1 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 		 263 aa  274  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  59.25 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  49.81 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  49.05 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  56.65 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.96 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.47 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 260 aa  224  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  45.72 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  51.88 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.04 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.49 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.83 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 		 256 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.82 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.74 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.2 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>