More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4822 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4822  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 285 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.91 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  42.14 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 264 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.21 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.17 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  42.14 
 
 		 263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 		 263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  44.15 
 
 		 263 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  42.01 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  43.21 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  44.64 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.38 
 
 		 262 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 262 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 262 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  43.11 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 		 258 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.57 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.35 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  36.2 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  36.2 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  31.77 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.01 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 265 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>