More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0592 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.73 
 
 
265 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
259 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 
257 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
263 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  44.31 
 
 
261 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
263 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
262 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 
263 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
263 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
261 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  48.03 
 
 
263 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
261 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
260 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  44.22 
 
 
263 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
257 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
260 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.23 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.62 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 
263 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 
264 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
263 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
280 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
263 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
258 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
263 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
262 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
262 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
263 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
263 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
276 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.83 
 
 
261 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 
263 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
263 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
261 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
261 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.61 
 
 
262 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
262 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
263 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
270 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
258 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
273 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
262 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
256 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
263 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
284 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
262 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
270 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.31 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
260 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
274 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
266 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
261 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
259 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
264 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
259 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
267 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
260 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
266 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 
261 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
265 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
263 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
260 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
267 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
263 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
266 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 
270 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
262 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
270 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
266 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
271 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>