More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4185 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 		 272 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 		 272 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2125  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  0.104837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11165  enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.192459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.86 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 		 280 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.46 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.84 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.63 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  39.67 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11164  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.351304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.36 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3130  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3470  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.08 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>