More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3163 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  82.42 
 
 		 274 aa  410  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  77.33 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  74.49 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  78.54 
 
 		 263 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  75.81 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  78.54 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  75.71 
 
 		 263 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  76.92 
 
 		 263 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  74.49 
 
 		 263 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  74.49 
 
 		 263 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  75.61 
 
 		 263 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  74.49 
 
 		 263 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  74.9 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  68.2 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  68.97 
 
 		 262 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  67.82 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  62.75 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 263 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  59.14 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  57.66 
 
 		 276 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 		 264 aa  293  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 		 263 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  59.53 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  59.53 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  58.75 
 
 		 262 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  55.82 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  49.42 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.95 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  52.24 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.92 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  47.71 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  45.53 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.08 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  55.42 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  50.41 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 		 263 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 		 267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.22 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.48 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.47 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 259 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  46.27 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.4 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  37.73 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>