More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3726 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 258 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.11 
 
 		 258 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.5 
 
 		 258 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.84 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  46 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  48.25 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  42.91 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  45.59 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  45.59 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.6 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  41.02 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.5 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  44.18 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  47.37 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  43.2 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  43.97 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.09 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>