More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3600 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.47 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  39.55 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.87 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.1 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 		 276 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  42.26 
 
 		 263 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.54 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.75 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  41.89 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  39.23 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  39.48 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>