More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0290 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.07 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  43.61 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  49.06 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.45 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.46 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 294 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.83 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.92 
 
 		 661 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.4 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.91 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.94 
 
 		 662 aa  139  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 282 aa  138  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.46 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>